Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01736 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01736 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01736 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01736 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01736 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01736 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01736 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01736 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01736 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01736 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01736 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01736 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01736 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01736 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01736 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01736 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01736 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01736 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01736 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01736 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01736 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01736 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01736 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01736 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01736 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01736 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01736 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01736 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01736 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01736 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01736 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01736 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01736 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01736 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01736 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01736 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01736 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01736 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01736 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01736 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01736 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01736 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01736 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01736 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01736 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01736 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01736 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01736 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01736 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01736 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01736 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01736 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01736 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01736 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01736 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01736 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01736 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01736 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01736 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01736 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01736 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01736 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01736 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01736 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01736 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01736 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01736 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01736 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01736 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01736 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01736 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01736 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01736 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01736 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01736 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01736 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01736 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01736 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01736 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01736 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01736 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01736 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01736 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01736 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01736 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01736 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01736 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01736 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01736 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01736 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01736 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01736 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01736 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01736 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01736 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01736 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01736 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01736 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01736 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms