Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Odc1P00860 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Odc1P00860 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Odc1P00860 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Odc1P00860 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Odc1P00860 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Odc1P00860 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odc1P00860 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odc1P00860 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odc1P00860 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odc1P00860 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odc1P00860 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odc1P00860 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odc1P00860 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odc1P00860 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms