Protein–RNA interactions for Protein: O88855

Ltb4r, Leukotriene B4 receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb4rO88855 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ltb4rO88855 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ltb4rO88855 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ltb4rO88855 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ltb4rO88855 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms