Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Copb2O55029 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Copb2O55029 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Copb2O55029 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Copb2O55029 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Copb2O55029 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Copb2O55029 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Copb2O55029 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Copb2O55029 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Copb2O55029 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Copb2O55029 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Copb2O55029 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Copb2O55029 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Copb2O55029 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Copb2O55029 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms