Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NmiO35309 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NmiO35309 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NmiO35309 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NmiO35309 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NmiO35309 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NmiO35309 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NmiO35309 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NmiO35309 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NmiO35309 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NmiO35309 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NmiO35309 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NmiO35309 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NmiO35309 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NmiO35309 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NmiO35309 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NmiO35309 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NmiO35309 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NmiO35309 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NmiO35309 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NmiO35309 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NmiO35309 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NmiO35309 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NmiO35309 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NmiO35309 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NmiO35309 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NmiO35309 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NmiO35309 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NmiO35309 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NmiO35309 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NmiO35309 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NmiO35309 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NmiO35309 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NmiO35309 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NmiO35309 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NmiO35309 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NmiO35309 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NmiO35309 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NmiO35309 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NmiO35309 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NmiO35309 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NmiO35309 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NmiO35309 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NmiO35309 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NmiO35309 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NmiO35309 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NmiO35309 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NmiO35309 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NmiO35309 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NmiO35309 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NmiO35309 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NmiO35309 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NmiO35309 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NmiO35309 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NmiO35309 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NmiO35309 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NmiO35309 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NmiO35309 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NmiO35309 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NmiO35309 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NmiO35309 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NmiO35309 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NmiO35309 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NmiO35309 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NmiO35309 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NmiO35309 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NmiO35309 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NmiO35309 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NmiO35309 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NmiO35309 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NmiO35309 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NmiO35309 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NmiO35309 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NmiO35309 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NmiO35309 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NmiO35309 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NmiO35309 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NmiO35309 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NmiO35309 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NmiO35309 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NmiO35309 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NmiO35309 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NmiO35309 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NmiO35309 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NmiO35309 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NmiO35309 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NmiO35309 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NmiO35309 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NmiO35309 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NmiO35309 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NmiO35309 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NmiO35309 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NmiO35309 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NmiO35309 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NmiO35309 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NmiO35309 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NmiO35309 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NmiO35309 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NmiO35309 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NmiO35309 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms