Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ltbp2O08999 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ltbp2O08999 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ltbp2O08999 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ltbp2O08999 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ltbp2O08999 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms