Protein–RNA interactions for Protein: J3QMB3

Fam240b, Family with sequence similarity 240 member B, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240bJ3QMB3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam240bJ3QMB3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam240bJ3QMB3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms