Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20830J3KML6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20830J3KML6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20830J3KML6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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