Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AK157302I3ITR1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AK157302I3ITR1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AK157302I3ITR1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AK157302I3ITR1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms