Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf148G3X9R7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf148G3X9R7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf148G3X9R7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms