Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pde8bE9Q4S1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms