Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm3002E9PW72 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3002E9PW72 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3002E9PW72 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms