Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5483B2RV77 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5483B2RV77 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5483B2RV77 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5483B2RV77 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms