Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930402K13RikB1AW18 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930402K13RikB1AW18 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930402K13RikB1AW18 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms