Protein–RNA interactions for Protein: B1AR17

Chd3, Chromodomain helicase DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd3B1AR17 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd3B1AR17 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd3B1AR17 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chd3B1AR17 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd3B1AR17 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd3B1AR17 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd3B1AR17 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd3B1AR17 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd3B1AR17 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd3B1AR17 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd3B1AR17 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd3B1AR17 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd3B1AR17 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd3B1AR17 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd3B1AR17 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd3B1AR17 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd3B1AR17 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd3B1AR17 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms