Protein–RNA interactions for Protein: A7XUZ6

Skint6, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint6A7XUZ6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint6A7XUZ6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Skint6A7XUZ6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint6A7XUZ6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms