Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf39A2RT81 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf39A2RT81 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf39A2RT81 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf39A2RT81 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf39A2RT81 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf39A2RT81 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf39A2RT81 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf39A2RT81 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf39A2RT81 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf39A2RT81 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf39A2RT81 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf39A2RT81 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf39A2RT81 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf39A2RT81 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf39A2RT81 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf39A2RT81 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms