Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ism1A2ATD1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ism1A2ATD1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ism1A2ATD1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms