Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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