Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms