Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtmr1Q9Z2C4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms