Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn8Q9Z260 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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