Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccne2Q9Z238 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms