Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms