Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1G4

Atp6v0a1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0a1Q9Z1G4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0a1Q9Z1G4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms