Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog1Q9Z160 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms