Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms