Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NgfrQ9Z0W1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms