Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabbr1Q9WV18 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms