Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms