Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms