Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Usp21Q9QZL6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp21Q9QZL6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Usp21Q9QZL6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp21Q9QZL6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms