Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd4Q9QY39 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms