Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxe3Q9QY14 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms