Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms