Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms