Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf1Q9QX66 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dpf1Q9QX66 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dpf1Q9QX66 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf1Q9QX66 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf1Q9QX66 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf1Q9QX66 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf1Q9QX66 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf1Q9QX66 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf1Q9QX66 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf1Q9QX66 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf1Q9QX66 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf1Q9QX66 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf1Q9QX66 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms