Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc5Q9QX29 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms