Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vstm2bQ9JME9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vstm2bQ9JME9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms