Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms