Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp4Q9JHB3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp4Q9JHB3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms