Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkrn2Q9ERV1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms