Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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