Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD03

Rab13, Ras-related protein Rab-13, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab13Q9DD03 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab13Q9DD03 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms