Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB54

Fam216a, Protein FAM216A, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam216aQ9DB54 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam216aQ9DB54 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam216aQ9DB54 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms