Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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