Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms