Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp12Q9D9M2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms