Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg7Q9D906 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg7Q9D906 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms