Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot8Q9D8X5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms